文路研究员建立了一种名为单细胞三重组学的测序技术（scTrio-Seq)，实现单细胞层面对肿瘤细胞进行拷贝数变异、甲基化水平和转录组水平的三重组学分析。利用这一技术，文路研究团队发现DNA拷贝数较多的区域中，基因表达量也随之增高，反之亦然，从单细胞水平证实了基因表达的剂量效应。文路研究员还对一例肝细胞癌组织进行三重组学测序分析，将该组织在三个组学层面分为两个不同的细胞亚群。其中数量较少的细胞亚群DNA拷贝数变异增多、DNA甲基化水平更高，表达更多转移相关基因。

此外，文路研究员还建立了一种名为甲基化CpG短串联扩增与测序技术，能够对外周血循环游离DNA中超甲基化CpG岛进行高通量的组学分析。近年来循环游离DNA的研究已经逐渐进入公众视野，而CpG岛在肿瘤细胞中大量存在，可以在肿瘤细胞释放的循环游离DNA中检测到。然而由于循环游离DNA的含量过低，导致检测异常困难。而通过甲基化CpG短串联扩增与测序技术，能够非常灵敏地检验到血液中的循环游离DNA中的CpG岛。文路研究员发现肝癌患者血浆CpG岛标记物可以分为两类，一类直接来源于肝癌组织，应一类由肝癌组织和癌旁组织共同释放，联合这两类标记物，能够高度精确地诊断出肝细胞癌。

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艾科试剂：文路研究员：肝癌异质性的单细胞三重组学及ccfDNA甲基化组分析

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