了解酸性土壤环境里中度嗜酸链霉菌的多样性, 调查其物种资源。【方法】用分散和差速离心法及选择性分离培养基从14 份云南酸性土壤样品中分离到367 株具有链霉菌培养特征的放线菌, 并进行了颜色分群。从各颜色类群中选取代表菌株共97 株, 通过显微形态观察和pH 梯度生长实验确定其中的中度嗜酸链霉菌。进一步从中筛选出16 株中度嗜酸链霉菌代表菌株, 进行16SrRNA 基因序列的相似性和系统发育分析, 并结合基因组DNA-DNA 相关性数据。【结果】分离菌株归为12 同的颜色类群, 其中80%属于中度嗜酸链霉菌, 其代表菌株在系统发育树上形成了8 个距离较远且与已知种不同的进化分枝, 可能代表链霉菌属内至少8 个不同的新基因种。【结论】用以上方法筛选出的中度嗜酸链霉菌可归为8 个不同于已知种的进化群, 说明云南酸性土壤含有丰富多样的中度嗜酸链霉菌新物种。
关键词：中度嗜酸链霉菌; 16S rRNA 基因; 系统发育分析; 多样性; 进化群
中图分类号：Q939 文献标识码：A 文章编号：0001-6209 (2008) 04-0421-05
在酸性和偏酸性自然环境特别是土壤中, 中度嗜酸放线菌(pH 生长范围4.5~7.5, 最适pH5.0~5.5)的数量远远超过严格嗜酸放线菌(pH 生长范围3.5~6.5,最适pH4.5), 而链霉菌是其中的绝对优势菌群, 人们推断中度嗜酸链霉菌在酸性土壤有机物质的降解和转化过程中扮演着重要角色[1~4]。近年来国内外的研究[4, 5]表明, 酸性土壤中嗜酸稀有放线菌具有较丰富的种属多样性。而对酸性环境中常见放线菌—链霉菌多样性的研究, 更有可能发现新的抗真菌活性物质和在低pH 下有高活性的酶类, 并且对阐明它们的生态作用具有普遍意义[6, 7]。1991 年, Park 等[8]用5S rRNA 基因序列对专性嗜酸链霉菌、中度嗜酸链霉菌和嗜中性链霉菌进行了系统发育学研究, 发现它们分别在进化树上形成独立分枝。2003 年, Kim 等[9]利用分散和差速离心法从酸性土壤中分离到3 株专性嗜酸链霉菌, 并建立了链嗜酸菌新属(Streptacidiphilus gen. nov.)。2004 年, Kim等[10]对一群中度嗜酸链霉菌的代表菌株KCTC 9926T进行了多相分类研究, 发现此菌株在链霉菌属内形成一个单独的分枝, 并将它所代表的菌群定为链霉菌属的一个新种(Streptomyces yeochonensis sp. nov.)。我们从云南酸性土壤中分离纯化到一批嗜酸链霉菌,通过表型特征和分子系统学分析, 对其中的中度嗜酸链霉菌的物种多样性进行了研究
